灵石禅院位于西山磐陀石旁，由明朝求凝禅师始建。清朝隆定、能立法师曾予重建。现有大雄宝殿是近年由妙善法师（已故）组织修建的。寺内有盘陀石、二龟听经石等，与慧济寺云扶石合称“普陀三奇石”。