惠林寺隶属临济宗妙心寺派，年代起源自公元1330年鎌仓时期，由赫赫有名的梦窓疎石国师开山与筑庭，京都西芳寺、天龙寺、鎌仓瑞泉寺也都由他筑庭。

公元1467年爆发的应仁之乱，战火几乎蔓烧全日本，使惠林寺与许多寺院同样陷入荒废无人管理的惨状，直到战国时代成为武田氏菩提寺才重振声威，并从京都延揽高僧。

快川绍喜本来是美浓国崇福寺住持，为了抵抗美浓国(现岐阜县南部)齐藤义隆的暴政亡命至尾州，武田信玄将他延聘到惠林寺担任住持，还给他三百贯文的香油钱。
武田军最有名的两面军旗：风林火山の旗「疾如风，徐如林，侵掠如火，不动如山」、与诹访法性の旗「南无诹访南宫法性上下大明神」，皆由快川绍喜提笔，本阵军旗真迹就在惠林寺的武田公宝物馆。武田信玄死时遗命密不发丧，三年后才在惠林寺举行丧礼，也是由快川主持。
正因为如此推心置腹的深厚情谊，天正10年(1582年)，当信玄之子武田胜赖众叛亲离在天目山自尽，名门甲斐武田氏嫡流终告灭亡，快川仍然义无反顾收容当时正好投靠武田的佐佐木承祯(信长包围网一员)，不理会织田官兵追讨，于是织田信忠放火烧寺。



当快川国师与百位僧人被逼到三门楼上后，快川于熊熊烈火中对着众僧吟道：「安禅不必须山水，灭却心头火自凉」辞世之句，毅然决然赴死，算是舍身回报武田知遇之恩。