隋唐时代，长安佛教盛行，由印度来长安传教及留学的僧侣，曾在寺内翻译佛经和传授密宗。大兴善寺因此成为当时长安翻译佛经的三大译场之一，成为中国佛教密宗的发源地，也是中印文化交流史上一个值得纪念的地方。唐玄宗开元年间，“开元三大士”善元畏、金刚智、不空到此寺传授密宗，成为当时长安翻译佛经的三大译场之一、中国佛教密宗的发源地。唐武宗会昌年间(公元841—846年)，大举灭佛。全国有4600余座寺院被拆毁，大兴善寺亦难逃劫难。以后屡有重修，以清康熙年间(公元1662—1722年)的修复工程最多，先后重修了方丈、殿堂、钟、鼓楼和山门等。清同治年间，寺院建筑再次被毁，仅存钟、鼓楼和前门。
　　现存寺院建筑沿正南正北方向呈一字形排列在中轴线上，依次是天王殿，内供弥勒菩萨;大雄宝殿。大兴善寺是一座具有中外影响的古刹，被列为陕西省重点文物保护单位。1983年被国务院列为全国重点开放寺院之一。