凈智寺是屬臨濟宗圓覺寺派的一個禪宗寺院,在鐮倉五山（鐮倉的五大禪宗寺廟)中位居第四位。
1281年前後,鐮倉幕府第五代攝政者北條時賴的三兒子北條宗政死後,宗政之妻以其亡夫宗政及其子師時為創始人創建了此寺廟。從鐮倉時代後期到室町時代前期的鼎盛時期,這裏曾經七堂伽藍齊全修建了多數塔頭。但後來漸漸走向衰退之路。現在的伽藍是1923年的關東大地震之後重新修建而成的。
登上叢樹林所包圍的參道石臺階,迎面前方有一座中國風格的鐘樓門,頂部懸掛著一個梵鐘。這在鐮倉是罕見的風格。鐘樓門的深處有一座被稱為曇華殿的佛殿,殿內供奉著主佛三世佛坐像。從左側依次為阿彌陀如來·釋迦如來·彌勒菩薩,各代表過去·現在·未來。被臘梅、櫻樹、杉樹、圓柏等自然森林所環抱的這裏,是一片萬籟俱寂的禪宗世界。